Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTGFP29279 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTGFP29279 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTGFP29279 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTGFP29279 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms