Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTNNA2P26232 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTNNA2P26232 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms