Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CTSSP25774 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CTSSP25774 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CTSSP25774 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CTSSP25774 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CTSSP25774 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms