Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTPRDP23468 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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