Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1P21675 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1P21675 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1P21675 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1P21675 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF1P21675 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1P21675 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1P21675 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF1P21675 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1P21675 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1P21675 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1P21675 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF1P21675 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF1P21675 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAF1P21675 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF1P21675 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1P21675 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1P21675 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1P21675 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1P21675 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF1P21675 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms