Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
AMY2BP19961 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms