Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BMP3P12645 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BMP3P12645 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BMP3P12645 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BMP3P12645 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms