Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CGB3P0DN86 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms