Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PNMA6AP0CW24 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PNMA6AP0CW24 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms