Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VIL1P09327 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VIL1P09327 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VIL1P09327 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms