Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NGFRP08138 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NGFRP08138 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NGFRP08138 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NGFRP08138 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NGFRP08138 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NGFRP08138 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NGFRP08138 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms