Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETM1O95202 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETM1O95202 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LETM1O95202 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LETM1O95202 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETM1O95202 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETM1O95202 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETM1O95202 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETM1O95202 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LETM1O95202 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LETM1O95202 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms