Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLSTN1O94985 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN1O94985 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms