Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA4O75676 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPS6KA4O75676 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms