Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRPF40AO75400 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms