Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
ABCC9O60706 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
ABCC9O60706 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
ABCC9O60706 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms