Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCA5O60264 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms