Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTPRTO14522 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
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