Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CYSRT1A8MQ03 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms