Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MAP1LC3B2A6NCE7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms