Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL355607.1-201ENST00000427745 295 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 EPHA6-204ENST00000502694 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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FOXQ1Q9C009 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
FOXQ1Q9C009 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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