Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-214ENST00000478442 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC9Q96Q05 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms