Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC004986.1-201ENST00000414855 607 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 OR5P4P-201ENST00000424698 917 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AP001628.1-201ENST00000431150 285 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MRPL49P1-201ENST00000505951 535 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC087277.1-201ENST00000529910 535 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL049780.1-201ENST00000554430 489 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 APEX1-214ENST00000557054 888 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC090826.1-201ENST00000564109 915 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZEB2-AS1-206ENST00000602006 572 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC129908.1-201ENST00000624553 648 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL157713.1-201ENST00000379752 1531 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 VEZF1P1-201ENST00000423931 1541 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CAGE1-208ENST00000512086 2537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TBX5-202ENST00000349716 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AL357556.1-201ENST00000421884 1388 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RNA5SP355-201ENST00000365317 135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 NR1I3-203ENST00000367981 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SCG3Q8WXD2 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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