Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CLDN19Q8N6F1 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CLDN19Q8N6F1 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms