Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FSCN1Q16658 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms