Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CDK15-201ENST00000260967 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC093277.1-201ENST00000637776 1622 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GPNMB-201ENST00000258733 2862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AL096816.1-201ENST00000623300 2920 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CCDC85BQ15834 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.3 ms