Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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SS18Q15532 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SS18Q15532 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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