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| BRD3 | Q15059 | AC013640.1-201 | ENST00000565366 | 565 nt | TSL 3 BASIC | 6.37 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC135178.3-202 | ENST00000580537 | 579 nt | TSL 3 BASIC | 6.37 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | DYNLL1P1-201 | ENST00000595442 | 269 nt | BASIC | 6.37 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC120053.1-201 | ENST00000607706 | 736 nt | BASIC | 6.37 | □□□□□ -1.39 | | |
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| BRD3 | Q15059 | PNPLA4-203 | ENST00000444736 | 2752 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL133351.3-201 | ENST00000454998 | 193 nt | BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC245088.1-201 | ENST00000486508 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL589743.6-201 | ENST00000611025 | 117 nt | BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
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| BRD3 | Q15059 | MIR8084-201 | ENST00000614105 | 89 nt | BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007786.3-201 | ENST00000615154 | 596 nt | BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007342.8-201 | ENST00000623278 | 678 nt | BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL138960.2-201 | ENST00000625145 | 535 nt | BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | MUC17-201 | ENST00000306151 | 14247 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007750.1-202 | ENST00000418968 | 4098 nt | TSL 5 BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | CC2D2B-201 | ENST00000344386 | 1809 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | IGSF10-201 | ENST00000282466 | 11067 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLC7A11-201 | ENST00000280612 | 9645 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | LRRC7-202 | ENST00000310961 | 6507 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | COPS4-209 | ENST00000511653 | 1695 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | KIAA1328-201 | ENST00000280020 | 4853 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.36 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | TEX11-202 | ENST00000374320 | 2224 nt | TSL 2 BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF573-217 | ENST00000590414 | 2225 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | RBMS2-202 | ENST00000542360 | 1484 nt | TSL 2 BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC217777.1-201 | ENST00000570034 | 1471 nt | BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF107-205 | ENST00000613690 | 5589 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | WDR72-203 | ENST00000557913 | 5900 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC019080.1-201 | ENST00000397057 | 5202 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | TCF7L2-206 | ENST00000355995 | 4073 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | PSMA3-201 | ENST00000216455 | 970 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL39P5-201 | ENST00000273411 | 449 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF486-201 | ENST00000335117 | 3837 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA64.3-201 | ENST00000365647 | 134 nt | BASIC | 6.35 | □□□□□ -1.39 | | |