Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL4A6Q14031 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
COL4A6Q14031 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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