Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms