Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC011500.1-201ENST00000601963 469 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
FHL3Q13643 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.9 ms