Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF431-206ENST00000599296 586 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL591222.2-201ENST00000604443 754 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GBA3-207ENST00000613293 1233 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TOP3AQ13472 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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