Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
SRSF5Q13243 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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