Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
SREBF2Q12772 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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