Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 DOCK1-206ENST00000623213 5761 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SYK-202ENST00000375747 4908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SERPINA10-201ENST00000261994 4978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 TNC-202ENST00000350763 7641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 KANSL3-206ENST00000431828 5153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SHROOM4-202ENST00000376020 9556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 INTS7-203ENST00000366994 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 CDH7-202ENST00000397968 12231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 SCN10A-201ENST00000449082 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MYOM1-202ENST00000356443 5847 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PKHD1P08F94 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms