Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CLDN25C9JDP6 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms