Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1Q9Y3L3 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms