Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COPS7AQ9UBW8 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms