Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 PPARG-204ENST00000397000 1122 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.9 ms