Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL161793.1-201ENST00000435021 445 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SGCZQ96LD1 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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