Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TAF1AQ15573 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms