Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
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PUM3Q15397 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PUM3Q15397 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PUM3Q15397 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PUM3Q15397 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PUM3Q15397 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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