Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 GRAMD1B-207ENST00000529750 7723 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ZNF573-202ENST00000357309 2124 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 AC004690.2-201ENST00000472838 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
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CHD4Q14839 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CHD4Q14839 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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