Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
ITGA9Q13797 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms