Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
CACNA1SQ13698 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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