Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CDH18Q13634 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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