Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RCHY1-206ENST00000507014 650 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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IFT88Q13099 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
IFT88Q13099 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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