Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
PTPRGP23470 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
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