Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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PTPRAP18433 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01533-204ENST00000590719 435 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 WDR19-207ENST00000506503 2513 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 AC015871.3-201ENST00000618835 2261 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTPRAP18433 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 CARF-202ENST00000402905 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTPRAP18433 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTPRAP18433 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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