Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SNX18P25-201ENST00000510539 758 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC092652.2-201ENST00000552220 622 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
EHD3Q9NZN3 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.7 ms